1、运输部门的激励机制
进行运输决策时应确保运输战略对企业的发展战略起促进作用。如在决策时只考虑降低运输成本而不顾客户响应程度，将使企业总成本增加。所以企业运输部门的业绩考核应综合考虑运输成本、受运输决策影响的库存成本以及所达到的客户响应程度。
2、选择自营运输和外包运输
考虑使用自营运输，外包运输或二者兼而有之，应基于企业的运输管理能力和运输对企业发展战略的重要性。当运量较小、运输不是企业成功的关键因素时，可以将运输外包给第三方承担，节约成本。然而当运量大、客户响应程度重要时，运输对企业发展战略的成功影响非常大，企业应拥有自己的运输车队。
3、运输网络的柔性
进行运输网络设计是应考虑需求的不确定性和运输的可利用性。忽视需求不确定性会导致大量采用廉价、非柔性的运输方式，如果运输计划不变，这种运输网络会执行得很好。然而当运输计划改变时，往往就很差劲。如果企业考虑了不确定性，在运输网络设计中采用一些柔性的运输方式，虽然会昂贵一些，但可以让企业以较低的成本提供高水平的客户响应。
4、运输成本与其他相关成本
供应链中的运输决策必须考虑对库存成本、设备和加工处理成本上升，协作成本以及提供给客户的响应水平、对不同的运输配置进行评估，按不同的成本、收入以及协作的复杂性把它分成不同的等级，然后进行合适的运输决策。
（1）运输与库存成本
运输与库存成本间的权衡包括运输方式的选择和库存集中。
1、运输方式的选择。包括规划决策和运作决策两方面，规划决策侧重于承运商的选择，运作决策针对的是某次运货的具体运输方式的选择。对于这两种决策，发货方都必须权衡运输与库存成本。成本最低的运输方式不一定降低供应链总成本，越廉价的运输方式提前期越长，装货量也越大，库存水平升高；装载量小的运输方式可降低库存水平，但相对昂贵。因此，价值与重量比值高的货物适合速度快的运输方式，对它来说降低库存是重要的；比值低的货物则适合速度慢的运输方式，对它来讲降低运输成本是重要的。
2、库存集中。将分散的库存集中起来可以使企业显著降低安全库存，然而集中库存会增加运输成本。当库存、设备成本占供应链总成本很大一部分时，集中库存是一个可以考虑的办法。对价值与重量比值高并且具有高度需求不确定性的货物集中库存也是有效的。
（2）运输成本与客户响应
供应链中运输成本与供应链提供的客户响应程度密切相关。如果企业的响应程度高、当天从客户接收到的订单当天完成，由于运量小、车辆利用率低，将导致很高的运输成本。反过来，如果降低响应程度，在发货前经过一段时间集中订单，将会因运量增大带来的规模经营而使运输成本降低，但集中订单因为耽搁了及时发货使客户响应程度降低。